暴力横行的圣菲克什高中，假面教师荒木刚太（藤ヶ谷太輔 饰）接受调令来到这所学校任教。他被安排辅助贺东麻耶老师（夏菜 饰）教导问题重重的3年D班。在这里，老师和学生被禁止交流，讲台前的地面上画着醒目的黄线，双方均默契地不越过这条警戒线。从校长处了解到，两年前已经处在崩溃边缘的圣菲克什高中依靠假面教师的

近未来的日本，政府颁布全面禁止体罚学生的法令，但是学校的威严也一落千丈，各种欺凌不公横行学校。为此政府制定了“假面教师计划”，允许戴着面具的特别教师在荒废的校园里对不服管教的学生施以铁拳惩罚

2004年的一天，致力于成为推理小说作家的英都大学学生有栖川有栖（窪田正孝 饰）在教室内奋笔疾书，这时专事犯罪心理学研究的副教授火村英生（斋藤工 饰）走到他的跟前，饶有兴致的阅读了有栖川的作品。对于一直致力于追求完美犯罪，甚至在梦中都会将自己化身为凶手的火村英生来说，有栖川的作品让他得到了鲜有的喜悦