主人公游城十代在前往决斗学院的入学考试途中，与传说的决斗者武藤游戏相遇，并接受了武藤游戏的一张卡片。但是十代最终迟到并错过了考试。为此十代恳求克洛诺斯教授让他通过考试，并由此展开了决斗者之路。

隆（清水宏次朗 配音）和肯（羽贺研二 配音）是年轻的武道家，毕生的理想就是追求更强健的体魄和更强大的力量，为了磨炼技艺，两人结伴而行开始了周游世界的旅程，只为了寻找更加强大的对手，探索各自的极限。 　　一路上，两人遇见了许多和他们志同道合的好友——活泼可爱的春丽（藤谷美纪 配音）、刚正不阿的古烈（