故事发生在遥远的未来，肆虐的异生兽给人类的安全带来了巨大的困扰，为了抵挡异兽的进攻，日本政府成立了防卫组织TLT，其中，夜袭队拥有着最强大的实力和最强劲的武器，是整个组织内部的中坚力量。 　　然而，面对经过了进化的新型异生兽，夜袭队亦束手无策，在这个节骨眼上，光之巨人奈克瑟斯奥特曼和它的适能者姫矢准

摄影师増岡（塚本晋也 饰）性格压抑，对人类的恐惧有浓厚的兴趣。一日他凑巧拍下了陌生男子阿礼在地铁刺瞎自己的右眼，増岡反复研究录像，并为实地考察阿礼自残的原因回到现场，他从地铁的设备管道深入地下，惊见已经泯灭的地下文明遗址，并带回一名被锁在遗迹中的赤裸女子。 　　増岡称女子为“F”，自此他和F同居一